研究组介绍
随着测序技术的发展以及组学数据的指数型增长,基于数据驱动的植物分子设计育种已经成为植物科学研究中一个重要的手段。本课题组以多组学测序技术/生物信息学作为基础研究手段,以药用植物、园艺植物等作为研究对象,探讨植物生长发育、环境应答等过程中的遗传信息传递、表达以及调控的分子机制。
一、研究方向:
1. 基于多组学测序技术的药用植物、园艺植物关键经济性状形成的调控分子机制解析;
2. 药用植物、园艺植物基因编辑技术的应用。
二、研究组成员
姓名 | 职务 | 职称/学位 | 研究领域 | 联系方式 |
研究组长 | 副研究员/博士 | 植物功能基因组学、生物信息学、植物分子生物学、植物基因编辑 | huangmk@lsbg.cn | |
研究组员 | 副研究员/博士 | 植物转录因子功能研究、植物基因编辑 | zhangl@lsbg.cn | |
研究组员 | 副研究员/博士 | 合成生物学、功能基因组编辑、合成基因组学、植物基因组学 | hua.yang1@uq.net.au | |
研究组员 | 研究实习员/硕士 | 药用植物、园艺植物基因编辑 | yufanghu163@163.com | |
田淑云 | 研究组员 | 科研助理/硕士 | 药用植物代谢研究 | shuytian@163.com |
杨浪 | 研究组员 | 科研助理/硕士 | 植物基因功能研究 | LangYang1124@Outlook.com |
熊盈 | 研究组员 | 科研助理/本科 | 生物信息学 | 2974692447@qq.com |
硕士研究生 | 学生 | 生物信息学 | liangqi0611@163.com | |
硕士研究生 | 学生 | 生物信息学 | Lv.Xingbin@outlook.com | |
张志怡 | 硕士研究生 | 学生 | 植物分子生物学与生物化学 | belief779@163.com |
研究组长
姓 名: | 黄铭坤 | 研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
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职 务: | 研究组长 | 职 称: | 副研究员 |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞农业园科研中心 | ||
邮政编码: | 330114 | 电子邮箱: | huangmk@lsbg.cn |
姓 名: | 黄铭坤 |
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研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
职 务: | 研究组长 |
职 称: | 副研究员 |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞农业园科研中心 |
邮政编码: | 330114 |
电子邮箱: | huangmk@lsbg.cn |
学习经历:
2012年9月-2016年1月 中国科学院华南植物园 博士
2009年9月-2012年6月 华南农业大学 硕士
2005年9月-2009年6月 华南农业大学 学士
工作经历:
2022年1月-至今 江西省、中国科学院庐山植物园
2018年3月-2021年12月 香港中文大学
2016年3月-2018年2月 北京中药研究所/北京诺禾致源生物科技公司
研究领域:
1. 植物功能基因组学、生物信息学 (Dry lab);
2. 植物分子生物学、植物基因编辑 (Wet lab);
承担科研项目情况:
1. 国家自然基金地区面上项目,主持
2. 江西省高层次与紧缺型人才计划项目,主持
3. 江西省自然科学基金面上项目,主持
4. 庐山植物园专项基金,主持
5. 香港中文大学优秀博士后基金项目 (Impact Postdoctoral Fellowship Scheme of The Chinese University of Hong Kong) ,主持
6. 香港AoE 项目 (Hong Kong Research Grants Council Area of Excellence Scheme, AoE/M-403/16),参与
7. 香港罗桂祥基金项目 (Lo Kwee-Seong Biomedical Research Fund),参与
8. 中国博士后创新计划 (BX201600155) 基金项目,主持
论文及论著:
--2024--
1. Huang, M.#, Hu, Y., Zhang, L., Yang, H., Feng, C., Jiang, C., Xie, N., Liu, D., Chen, S., Wang, J., et al. (2024). Decoding the chromatin accessibility in Andrographis paniculata genome, a case study of genome-wide investigation of the cis-regulatory elements in medicinal plants. Acta Pharm Sin B 14:4179-4182. 10.1016/j.apsb.2024.06.012.
2. Jia, T., Yang, H., Zhou, D., Zhao, S., Wang, J., Zhang, T., Huang, M., Kong, D., and Liu, Y. (2024). Establishment of a Genetic Transformation and Gene Editing Method by Floral Dipping in Descurainia sophia. Plants (Basel) 1310.3390/plants13202833.
3. Wang, J., Pu, Z., Zhang, W., Qu, M., Gao, L., Pan, W., Sun, Y., Fu, C., Zhang, L., Huang, M.#, Yufang Hu#. (2024). Identification of the New GmJAG1 Transcription Factor Binding Motifs Using DAP-Seq. Plants (Basel) 1310.3390/plants13121708.
4. Yung, W.S., Wang, Q., Chan, L.Y., Wang, Z., Huang, M., Li, M.W., Wong, F.L., and Lam, H.M. (2024). DNA Hypomethylation Is One of the Epigenetic Mechanisms Involved in Salt-Stress Priming in Soybean Seedlings. Plant Cell Environ 10.1111/pce.15297.
专利申请
冯晨、黄铭坤、刘亚芳、张弋、张强,2024,协同抑制乙酰胆碱酯酶的加兰他敏组合物,发明专利,CN116570600B
--2023--
1. Huang, M#., Zhang, L., Yung, W.-S., Hu, Y., Wang, Z., Li, M.-W., and Lam, H.-M. (2023). Molecular evidence for enhancer–promoter interactions in light responses of soybean seedlings. Plant Physiol 10.1093/plphys/kiad487.
2. Su, W., Zhu, C., Fan, Z., Huang, M., Lin, H., Chen, X., Deng, C., Chen, Y., Kou, Y., Tong, Z., et al. (2023). Comprehensive metabolome and transcriptome analyses demonstrate divergent anthocyanin and carotenoid accumulation in fruits of wild and cultivated loquats. Front Plant Sci 14:1285456. 10.3389/fpls.2023.1285456.
3. Zhang, L., Yung, W.-S., Hu, Y., Wang, L., Sun, W., and Huang, M#. (2023). Establishment of a convenient ChIP-seq protocol for identification of the histone modification regions in the medicinal plant Andrographis paniculata. Medicinal Plant Biology 210.48130/MPB-2023-0006.
4. Zhu, W., Huang, J., Huang, M., and Lu, P. (2023). ATAC-Me simultaneously decodes chromatin accessibility and DNA methylation. Trends Plant Sci 28:968-969. 10.1016/j.tplants.2023.05.013.
--2022--
1. Zhang L, Yung WS, Huang M# (2022) STARR-seq for high-throughput identification of plant enhancers. Trends Plant Sci 27(12):1296-1297
2. Zhang L, Yung WS, Sun W, Li MW, Huang M# (2022) Genome-wide characterization of Nuclear Factor Y transcription factors in Fagopyrum tataricum. Physiol Plant: e13668
3. Zhang L, Yung WS, Wang Z, Li MW, Huang M# (2022) Optimization of an Efficient Protoplast Transformation System for Transient Expression Analysis Using Leaves of Torenia fournieri. Plants (Basel) 11(16)
4. Huang M, Zhang L, Zhou L, Yung WS, Wang Z, Xiao Z, Wang Q, Wang X, Li MW, Lam HM# (2022) Identification of the accessible chromatin regions in six tissues in the soybean. Genomics 114(3): 110364
5. Wang G, Li X, Shen W, Li M-W, Huang M, Zhang J, Li H# (2022) The chromatin accessibility landscape of pistils and anthers in rice. Plant Physiol
6. Wang Z, Huang C, Niu Y, Yung W-S, Xiao Z, Wong F-L, Huang M, Wang X, Man C-K, Sze C-C, Liu A, Wang Q, Chen Y, Liu S, Wu C, Liu L, Hou W, Han T, Li M-W, Lam H-M# (2022) QTL analyses of soybean root system architecture revealed genetic relationships with shoot-related traits. Theoretical and Applied Genetics 135(12): 4507-4522
7. Xiao Z, Wang Q, Li M-W, Huang M, Wang Z, Xie M, Varshney RK, Nguyen HT, Chan T-F, Lam H-M# (2022) Wildsoydb DataHub: a platform for accessing soybean multiomic datasets across multiple reference genomes. Plant Physiol
--2021--
1. Huang M, Li MW, Lam HM# (2021) How noncoding open chromatin regions shape soybean domestication. Trends Plant Sci 26(9):876-878.
2. Huang M, Zhang L, Zhou L, Wang M, Yung W-S, Wang Z, Duan S, Xiao Z, Wang Q, Wang X, Li M-W, Lam H-M# (2021) An expedient survey and characterization of the soybean JAGGED 1 (GmJAG1) transcription factor binding preference in the soybean genome by modified ChIPmentation on soybean protoplasts. Genomics 113(1): 344-355
3. Huang M, Zhang L, Zhou LM, Yung WS, Li MW, Lam HM# (2021) Genomic Features of Open Chromatin Regions (OCRs) in Wild Soybean and Their Effects on Gene Expressions. Genes 12(5)
4. Zhang L, Zhou L, Yung WS, Su W, Huang M# (2021) Ectopic expression of Torenia fournieri TCP8 and TCP13 alters the leaf and petal phenotypes in Arabidopsis thaliana. Physiol Plant
5. Yung WS, Wang Q, Huang M, Wong FL, Liu A, Ng MS, Li KP, Sze CC, Li MW, Lam HM# (2021) Priming-induced alterations in histone modifications modulate transcriptional responses in soybean under salt stress. Plant J
6. Wang G, Li X, Ye N, Huang M, Feng L, Li H, Zhang J# (2021) OsTPP1 regulates seed germination through the crosstalk with abscisic acid in rice. New Phytol
--2021以前--
1. Sun W, Leng L, Yin Q, Xu M, Huang M, Xu Z, Zhang Y, Yao H, Wang C, Xiong C, Chen S, Jiang C, Xie N, Zheng X, Wang Y, Song C, Peters RJ, Chen S# (2019) The genome of the medicinal plant Andrographis paniculata provides insight into the biosynthesis of the bioactive diterpenoid neoandrographolide. Plant J 97(5): 841-857
2. Hu Y, Zhou L, Huang M, He X, Yang Y, Liu X, Li Y, Hou X# (2018) Gibberellins play an essential role in late embryogenesis of Arabidopsis. Nature Plants 4(5): 289-298
3. Liu X, Hu P, Huang M, Tang Y, Li Y, Li L, Hou X# (2016) The NF-YC–RGL2 module integrates GA and ABA signalling to regulate seed germination in Arabidopsis. Nature Communications 7(1): 12768
4. Huang M, Hu Y, Liu X, Li Y, Hou X# (2015) Arabidopsis LEAFY COTYLEDON1 controls cell fate determination during post-embryonic development. Front Plant Sci 6: 955
5. Huang M, Hu Y, Liu X, Li Y, Hou X# (2015) Arabidopsis LEAFY COTYLEDON1 Mediates Postembryonic Development via Interacting with PHYTOCHROME-INTERACTING FACTOR4. Plant Cell 27(11): 3099-3111
6. Huang M, Ma C, Yu R, Mu L, Hou J, Yu Y, Fan Y# (2015) Concurrent changes in methyl jasmonate emission and the expression of its biosynthesis-related genes in Cymbidium ensifolium flowers. Physiol Plant 153(4): 503-512
研究组员
姓 名: | 张玲 | 研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
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职 务: | 研究组员 | 职 称: | 副研究员 |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞农业园科研中心 | ||
邮政编码: | 330114 | 电子邮箱: | zhangl@lsbg.cn |
姓 名: | 张玲 |
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研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
职 务: | 研究组员 |
职 称: | 副研究员 |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞农业园科研中心 |
邮政编码: | 330114 |
电子邮箱: | zhangl@lsbg.cn |
学习经历:
2013年9月-2016年6月 华南农业大学 博士 园艺学院果树学专业
2009年9月-2012年6月 华南农业大学 硕士 园艺学院果树学专业
2005年9月-2009年6月 武汉科技学院 本科 生物工程专业
工作经历:
2021年7月-至今 江西省、中国科学院庐山植物园 副研究员 植物功能基因组学研究组
2016年8月-2021年6月 深圳大学 博士后 生命与海洋科学学院植物表观遗传课题组
2012年7月-2013年7月 华南植物园 研究助理 植物代谢课题组
任职经历:
2021年8月-至今 江西省、中国科学院庐山植物园 组员 植物功能基因组学研究组
获奖及荣誉:
2014年5月 获2013-2014学年度优秀博士研究生二等奖
2016年5月 获2015-2016学年度优秀博士研究生一等奖
研究领域:
植物转录因子功能研究;植物基因编辑;
承担科研项目情况:
1. 江西省自然科学基金-青年基金项目,光照调控穿心莲中穿心莲内酯积累的分子机制解析,2023/07-2025/06,主持;
2. 中国科学院庐山植物园,庐山植物园专项,园艺植物转录因子预测及功能分析,2021/12-2023/12,主持;
3. 国家自然科学基金-地区科学基金项目,基于 ATAC-seq 策略挖掘穿心莲基因组中调控穿心莲内酯合成的增强子,2023/01-2026/12,参与;
4. 江西省自然科学基金-面上项目,大豆光响应增强子元件的鉴定和功能分析,2023/07-2025/06,参与。
论文及论著:
1. Huang M, Hu Y, Zhang L, Yang H, Feng C, Jiang C, Xie N, Liu D, Chen S, Wang J, Sun W*. Decoding the chromatin accessibility in Andrographis paniculata genome, a case study of genome-wide investigation of the cis-regulatory elements in medicinal plants. Acta Pharm Sin B. 2024, 14(9):4179-4182.
2. Zhang L, Yung WS, Hu YF, Wang LP, Sun W, Huang MK*. Establishment of a convenient ChIP-seq protocol for identification of the histone modification regions in the medicinal plant Andrographis paniculata. Medicinal Plant Biology. 2023, 2:6.
3. Huang MK, Zhang L, Yung WS, Hu Y, Wang Z, Li MW, Lam HM*. Molecular evidence for enhancer-promoter interactions in light responses of soybean seedlings. Plant Physiol. 2023, 193(4):2287-2291.
4. Zhang L, Yung WS, Huang M*. STARR-seq for high-throughput identification of plant enhancers. Trends Plant Sci. 2022, 27(12):1296-1297.
5. Zhang L, Yung WS, Wang Z, Li MW, Huang M*. Optimization of an Efficient Protoplast Transformation System for Transient Expression Analysis Using Leaves of Torenia fournieri. Plants (Basel). 2022, 11(16):2106.
6. Zhang L, Yung W, Sun W, Li MW, Huang M*. Genome-wide characterization of nuclear factor Y transcription factors in Fagopyrum tataricum. Physiol Plant. 2022, 174(2):e13668.
7. Huang M, Zhang L, Zhou L, Yung WS, Wang Z, Xiao Z, Wang Q, Wang X, Li MW, Lam HM*. Identification of the accessible chromatin regions in six tissues in the soybean. Genomics. 2022, 114(3):110364.
8. Zhang L, Zhou L, Yung WS, Su W*, Huang M*. Ectopic expression of Torenia fournieri TCP8 and TCP13 alters the leaf and petal phenotypes in Arabidopsis thaliana. Physiol Plant. 2021, 173(3):856-866.
9. Yu H#, Zhang L#, Wang W, Tian P, Wang W, Wang K, Gao Z, Liu S, Zhang Y, Irish VF, Huang T*. TCP5 controls leaf margin development by regulating the KNOX and BEL-like transcription factors in Arabidopsis. J Exp Bot. 2021, 72(5):1809-1821.
10. Huang M, Zhang L, Zhou L, Wang M, Yung WS, Wang Z, Duan S, Xiao Z, Wang Q, Wang X, Li MW, Lam HM*. An expedient survey and characterization of the soybean JAGGED 1 (GmJAG1) transcription factor binding preference in the soybean genome by modified ChIPmentation on soybean protoplasts. Genomics. 2021, 113: 344-355.
11. Huang M, Zhang L, Zhou LM, Yung WS, Li MW, Lam HM*. Genomic Features of Open Chromatin Regions (OCRs) in Wild Soybean and Their Effects on Gene Expressions. Genes. 2021, 12(5):640.
12. Peng Z, Wang M, Zhang L, Jiang Y, Zhao C, Shahid MQ, Bai Y, Hao J, Peng J, Gao Y, Su W*, Yang X*. EjRAV1/2 Delay Flowering Through Transcriptional Repression of EjFTs and EjSOC1s in Loquat. Frontiers in plant science, 2021, 12:816086.
13. Su W, Jing Y, Lin S, Yue Z, Yang X, Xu J, Wu J, Zhang Z, Xia R, Zhu J, An N, Chen H, Hong Y, Yuan Y, Long T, Zhang L, Jiang Y, Liu Z, Zhang H, Gao Y, Liu Y, Lin H, Wang H, Yant L, Lin S*, Liu Z*. Polyploidy underlies co-option and diversification of biosynthetic triterpene pathways in the apple tribe. Proc Natl Acad Sci. 2021, 118(20):e2101767118.
14. Jiang Y, Zhu Y, Zhang L, Su W, Peng J, Yang X, Song H, Gao Y*, Lin S*. EjTFL1 genes promote growth but inhibit flower bud differentiation in loquat. Frontiers in plant science, 2020, 11.
15. Zhang L, Jiang Y, Zhu Y, Su W, Long T, Huang T, Peng J, Yu H, Lin S*, Gao Y*. Functional Characterization of GI and CO Homologs from Eriobotrya deflexa Nakai forma koshunensis. Plant cell reports, 2019, 38(5): 533-543.
16. Su W, Yuan Y, Zhang L, Jiang Y, Gan X, Bai Y, Peng J, Wu J, Liu Y*, Lin S*. Selection of the optimal reference genes for expression analyses in different materials of Eriobotrya japonica. Plant Methods, 2019, 15: 7.
17. Jiang Y, Peng J, Zhu Y, Su W, Zhang L, Jing Y, Lin S, Gao Y*. The Role of EjSOC1s in Flower Initiation in Eriobotrya japonica. Frontiers in plant science, 2019, 10:253.
18. Su W, Zhu Y, Zhang L, Yang X, Gao Y, Lin S*. The cellular physiology of loquat (Eriobotrya japonica Lindl.) fruit with a focus on how cell division and cell expansion processes contribute to pome morphogenesis. Scientia Horticulturae, 2017, 224: 142-149.
19. Zhang L, Yu H, Lin S*, Gao Y*. Molecular Characterization of FT and FD Homologs from Eriobotrya deflexa Nakai forma koshunensis. Frontiers in plant science, 2016, 7.
20. Zhou Y, Zhang L, Gui J, Dong F, Cheng S, Mei X, Zhang L, Li Y, Su X, Baldermann S, Watanabe N, Yang Z*. Molecular cloning and characterization of a short chain dehydrogenase showing activity with volatile compounds isolated from Camellia sinensis. Plant Molecular Biology Reporter, 2015, 33(2): 253-263.
研究组员
姓 名: | 杨华 | 研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
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职 务: | 研究组员 | 职 称: | 副研究员 |
通讯地址: | 江西省南昌市新建区溪霞现代农业园庐山植物园南昌科研中心 | ||
邮政编码: | 330114 | 电子邮箱: | hua.yang1@uq.net.au |
姓 名: | 杨华 |
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研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
职 务: | 研究组员 |
职 称: | 副研究员 |
通讯地址: | 江西省南昌市新建区溪霞现代农业园庐山植物园南昌科研中心 |
邮政编码: | 330114 |
电子邮箱: | hua.yang1@uq.net.au |
学习经历:
2014年10月-2019年11月 澳大利亚昆士兰大学 生物学 博士 指导老师:Prof. Jacqueline Batley, Prof. Dave Edwards
2011年9月-2014年7月 西北农林科技大学 作物遗传育种 硕士 指导老师:高翔 教 授
2007年9月-2011年6月 西北农林科技大学 种子科学与工程 学士
工作经历:
2023年12月-至今 江西省、中国科学院庐山植物园 副研究员
2022年9月-2023年11月 深圳澳阳生物科技有限公司 副总经理
2022年3月-2022年7月 中国科学院深圳先进技术研究院 合成生物学研究所 助理研究员
2020年1月-2022年2月 中国科学院深圳先进技术研究院 合成生物学研究所 博士后 合作导师:戴俊彪(杰青)研究员
获奖及荣誉:
深圳市海外高层次人才 C 类
广东省海外博士后人才支持项目
研究领域:
1. 合成生物学、功能基因组编辑、天然产物的异源表达系统的构建、植物底盘生物的构建。
2. 合成基因组学、大片段基因组及染色体合成。
3. 油菜抗病基因的发掘及油菜与真菌的互作。
4. 植物基因组学。
承担科研项目情况:
1. 中国博士后科学基金会面上项目,小立碗藓合成端粒研究,主持
2. 深圳合成生物学创新研究院主题项目,植物合成启动子与合成染色体的研究,参与
3. Establishing Novel Breeding Methods for Canola Improvement,参与
4. Towards effective control of blackleg of canola: Identification of novel sources of blackleg resistance genes,参与。
论文及论著:
1. Yang, H., N.S.M. Saad, M.I. Ibrahim, P.E. Bayer, T.X. Neik, A.A. Severn-Ellis, A. Pradhan, S. Tirnaz, D. Edwards, and J. Batley*, Candidate Rlm6 resistance genes against Leptosphaeria. maculans identified through a genome-wide association study in Brassica juncea (L.) Czern. Theoretical and Applied Genetics, 2021: 1-16.
2. Yang, H., P.E. Bayer, S. Tirnaz, D. Edwards, and J. Batley*, Genome-Wide Identification and Evolution of Receptor-Like Kinases (RLKs) and Receptor like Proteins (RLPs) in Brassica juncea. Biology, 2021. 10(1): 1-24.
3. Dolatabadian A., H. Yang, and J. Batley*. Case study for trait-related gene evolution: Disease resistance genes in Brassica napus. In: Liu S., Snowdon R. & Chaloub B. (eds) The Brassica napus genome. Springer. 2018.
4. Tirnaz, S., P.E. Bayer, F. Inturrisi, F. Zhang, H. Yang, A. Dolatabadian, T.X. Neik, A. Severn-Ellis, D.A. Patel, M.I. Ibrahim, A. Pradhan, D. Edwards, and J. Batley*, Resistance gene analogs in the Brassicaceae: Identification, characterization, distribution, and evolution. Plant Physiology, 2020. 184(2): 909-922.
5. Van de Wouw, A.P., Zhang, Y., Mohd Saad, N.S., Yang, H., Sheedy, E., Elliott, C.E., Batley, J. Molecular Markers for Identifying Resistance Genes in Brassica napus. Agronomy 2022, 12, 985.
6. Chen S, Hayward A, Dey SS, Choudhary M, Witt Hmon KP, Inturrisi FC, Dolatabadian A, Neik TX, Yang H, Siddique KHM, Batley J, Cowling WA. Quantitative Trait Loci for Heat Stress Tolerance in Brassica rapa L. Are Distributed across the Genome and Occur in Diverse Genetic Groups, Flowering Phenologies and Morphotypes. Genes (Basel). 2022. 13(2):296.
7. Inturrisi, F.#, P.E. Bayer#, H. Yang, S. Tirnaz, D. Edwards, and J. Batley*, Genome-wide identification and comparative analysis of resistance genes in Brassica juncea. Molecular Breeding, 2020. 40(8): 1-14.
8. 杨华, 高翔*, 陈其皎, 赵万春*, 董剑, 李晓燕, 簇毛麦新型 HMW-GS 的序列分析及加工品质效应鉴定. 作物学报, 2014. 40(4): 600-610.
9. 董剑, 杨华, 赵万春*, 李晓燕, 陈其皎,高翔, 普通小麦中国春–簇毛麦易位系 T1DL· 1VS 和T1DS· 1VL 的农艺和品质特性. 作物学报, 2013. 39(8): 1386-1390.
研究组员
姓 名: | 胡玉芳 | 研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
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职 务: | 研究组员 | 职 称: | 研究实习员 |
通讯地址: | 江西省南昌市新建区溪霞现代农业园庐山植物园南昌科研中心 | ||
邮政编码: | 330114 | 电子邮箱: | yufanghu163@163.com |
姓 名: | 胡玉芳 |
---|---|
研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
职 务: | 研究组员 |
职 称: | 研究实习员 |
通讯地址: | 江西省南昌市新建区溪霞现代农业园庐山植物园南昌科研中心 |
邮政编码: | 330114 |
电子邮箱: | yufanghu163@163.com |
学习经历:
2019年9月-2022年6月 福建农林大学 硕士 生物学专业
2015年9月-2019年6月 兰州理工大学 本科 生物工程专业
工作经历:
2022年11月-至今 江西省中国科学院庐山植物园 研究实习员
论文及论著:
1. Huang, M., Hu, Y., Zhang, L., Yang, H., Feng, C., Jiang, C., Xie, N., Liu, D., Chen, S., Wang, J., & Sun, W. Decoding the chromatin accessibility in Andrographis paniculata genome, a case study of genome-wide investigation of the cis-regulatory elements in medicinal plants. Acta Pharmaceutica Sinica. B, 2024, 14, 4179 - 4182.
2. Wang J, Pu Z, Zhang W, Qu M, Gao L, Pan W, Sun Y, Fu C, Zhang L, Huang M, Hu, Y#. Identification of the New GmJAG1 Transcription Factor Binding Motifs Using DAP-Seq. Plants. 2024; 13(12):1708.
3. Huang M, Zhang L, Yung WS, Hu Y, Wang Z, Li MW, Lam HM. Molecular evidence for enhancer-promoter interactions in light responses of soybean seedlings. Plant Physiol. 2023, 193(4):2287-2291.
4. Zhang, L., Yung, W., Hu, Y., Wang, L., Sun, W., & Huang, M. Establishment of a convenient ChIP-seq protocol for identification of the histone modification regions in the medicinal plant Andrographis paniculata. Medicinal Plant Biology, 2023.
5. Wang Q, Yu G, Chen Z, Han J, Hu Y, Wang K*. Optimization of protoplast isolation, transformation and its application in sugarcane (Saccharum spontaneum L.). The Crop Journal, 2021, 9(1): 133-142.
研究组员
姓 名: | 田淑云 | 研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
---|---|---|---|
职 务: | 科研助理 | 职 称: | |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞农业园科研中心 | ||
邮政编码: | 330114 | 电子邮箱: | shuytian@163.com |
姓 名: | 田淑云 |
---|---|
研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
职 务: | 科研助理 |
职 称: | |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞农业园科研中心 |
邮政编码: | 330114 |
电子邮箱: | shuytian@163.com |
学习经历:
2020年9月-2023年6月 江西中医药大学 硕士 中药学专业
2014年9月-2018年6月 江西中医药大学 本科 制药工程专业
工作经历:
2024年8月-至今 江西省、中国科学院庐山植物园 植物功能基因组 科研助理
2023年7月-2024年7月 赣江中药创新中心 质量研究工程师 中药质量研究组
2018年9月-2020年1月 江西省医药学校 教师 中医药系
获奖及荣誉:
2023年6月获2022-2023学年度省政府研究生奖学金
2023年6月被评为2023届优秀毕业研究生
研究领域:
药用植物代谢研究
论文及论著:
1. Xu YQ, Tian SY, Li RQ, Huang XF, Li FQ, Ge F, Huang W, Zhou Y*. Transcriptome characterization and identification of molecular markers (SNP, SSR, and Indels) in the medicinal plant Sarcandra glabra spp. [J]. Biomed Res Int, 2021, 2021: 9990910.
2. Tian SY, Tang Q, Zhou ZW, Li FQ, Peng XY, Xu YQ*, Huang H*. The complete chloroplast genome sequences of two ornamental Epimedium species (Berberidaceae) [J]. Mitochondrial DNA B Resour, 2022, 7(5): 878-880.
3. Tian S Y, Lv X, Li M, Tang Q, Huang H, Hu S, Li F, Xu Y Q*. Metabolomic and transcriptomic analysis of the flavonoid biosynthesis pathway in Epimedium sagittatum (Sieb. et Zucc.) Maxim. from distinct locations. Front Plant Sci. 2024, 15, 1424956.
4. 田淑云, 廖朝华, 周紫薇, 唐琴, 李风琴, 宋松平, 胡生福, 徐艳琴*. 植物代谢组学在药材质量评价中的研究进展与展望 [J].药学学报, 2022, 57(06): 1734-1749.
5. Wang C Y, Tian S Y, Tang Q, Zhou Z W, Peng X H, Cai X X, Xu Y Q*. Systematic quality evaluation of Epimedium wushanense T. S. Ying based on two quality control standards: total flavonoid glycosides and epimedin C [J]. Chem Biodivers, 2023, e202200579.
6. 李仁清, 田淑云, 李风琴, 葛菲, 宋松平, 胡生福, 徐艳琴*. 4种淫羊藿产量与质量的动态变化及最佳采收期研究 [J]. 时珍国医国药, 2022, 33(06): 1456-1462.
研究组员
姓 名: | 杨浪 | 研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
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职 务: | 科研助理 | 职 称: | |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞国家现代农业示范区科研中心 | ||
邮政编码: | 330114 | 电子邮箱: | LangYang1124@Outlook.com |
姓 名: | 杨浪 |
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研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
职 务: | 科研助理 |
职 称: | |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞国家现代农业示范区科研中心 |
邮政编码: | 330114 |
电子邮箱: | LangYang1124@Outlook.com |
学习经历:
2021年9月-2024年6月 南昌大学 硕士 动物学专业;
2017年9月-2021年6月 三峡大学 本科 生物科学专业;
工作经历:
2024年7月-至今 江西省、中国科学院庐山植物园 植物功能基因组 科研助理
研究领域:
水产贝类免疫/毒理研究(在研);植物基因功能研究。
论文及论著:
1. An J, Yang L, Hu Y, et al. Analysis of the immune function of Caspase-3 in Cristaria plicata. Fish Shellfish Immunol. 2023;143:109184.
2. Feng M, Hu Y, Yang L, et al. GST-Mu of Cristaria plicata is regulated by Nrf2/Keap1 pathway in detoxification microcystin and has antioxidant function. Aquat Toxicol. 2023;263:106708.
3. Wu J, Hou S, Yang L, et al. P62/SQSTM1 upregulates NQO1 transcription via Nrf2/Keap1a signaling pathway to resist microcystins-induced oxidative stress in freshwater mussel Cristaria plicata. Aquat Toxicol. 2023;255:106398.
4. Wu J, Liu W, Hou S, Wang Y, Fang H, Luo S, Yang L, et al. Identification of Nrf2/Keap1 pathway and its transcriptional regulation of antioxidant genes after exposure to microcystins in freshwater mussel Cristaria plicata. Dev Comp Immunol. 2023; 141: 104629.
研究组员
姓 名: | 熊盈 | 研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
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职 务: | 科研助理 | 职 称: | |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞国家现代农业示范区科研中心 | ||
邮政编码: | 330114 | 电子邮箱: | 2974692447@qq.com |
姓 名: | 熊盈 |
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研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
职 务: | 科研助理 |
职 称: | |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞国家现代农业示范区科研中心 |
邮政编码: | 330114 |
电子邮箱: | 2974692447@qq.com |
学习经历:
2021年9月-2024年6月 湖南食品药品职业学院
工作经历:
2024年12月-至今 江西省中国科学院庐山植物园 植物功能基因组 科研助理
2023年7月-2024年6月 江西省中国科学院庐山植物园 植物功能基因组 实习生
研究组员
姓 名: | 梁琦 | 研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
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职 务: | 硕士研究生 | 职 称: | |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞农业园科研中心 | ||
邮政编码: | 330114 | 电子邮箱: | liangqi0611@163.com |
姓 名: | 梁琦 |
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研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
职 务: | 硕士研究生 |
职 称: | |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞农业园科研中心 |
邮政编码: | 330114 |
电子邮箱: | liangqi0611@163.com |
学习经历:
2023年9月-至今 南昌大学 硕士 植物学专业 (联合培养)
2019年9月-2023年6月 福建农林大学 本科 林学专业。
研究领域:
生物信息学
研究组员
姓 名: | 吕兴斌 | 研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
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职 务: | 硕士研究生 | 职 称: | |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞农业园科研中心 | ||
邮政编码: | 330114 | 电子邮箱: | Lv.Xingbin@outlook.com |
姓 名: | 吕兴斌 |
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研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
职 务: | 硕士研究生 |
职 称: | |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞农业园科研中心 |
邮政编码: | 330114 |
电子邮箱: | Lv.Xingbin@outlook.com |
学习经历:
2023年9月-至今 江西中医药大学 硕士 中药学专业 (联合培养)
研究领域:
生物信息学
论文及论著:
1. Tian S, Lv X, Li M, Tang Q, Huang H, Hu S, Li F and Xu Y (2024) Metabolomic and transcriptomic analysis of the flavonoid biosynthesis pathway in Epimedium sagittatum (Sieb. et Zucc.) Maxim. from distinct locations. Front. Plant Sci. 15:1424956. doi: 10.3389/fpls.2024.1424956
研究组员
姓 名: | 张志怡 | 研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
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职 务: | 硕士研究生 | 职 称: | |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞国家现代农业示范区科研中心 | ||
邮政编码: | 330114 | 电子邮箱: | belief779@163.com |
姓 名: | 张志怡 |
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研 究 组: | 植物功能基因组研究组 |
职 务: | 硕士研究生 |
职 称: | |
通讯地址: | 江西省南昌市溪霞镇溪霞国家现代农业示范区科研中心 |
邮政编码: | 330114 |
电子邮箱: | belief779@163.com |
学习经历:
2024年9月-至今 南昌大学 硕士 生物化学与分子生物学专业 (联合培养)
研究领域:
植物分子生物学与生物化学;生物信息学